MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Flavobacterium columnare ATCC 49512 chromosome

Total Repeats: 13348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016510	AATT	2	8	1	8	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016510	ATA	2	6	2216	2221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016510	T	6	6	2269	2274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016510	ATATTT	2	12	2279	2290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016510	T	6	6	2288	2293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016510	GTT	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016510	GAAA	2	8	2316	2323	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016510	TAA	2	6	2348	2353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016510	ATT	2	6	2357	2362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016510	AGCG	2	8	3117	3124	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016510	T	7	7	3126	3132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016510	TTTTTA	2	12	3143	3154	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016510	AAG	2	6	3611	3616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016510	T	6	6	3624	3629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016510	AGT	2	6	3668	3673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016510	A	8	8	4266	4273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016510	A	6	6	4337	4342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016510	T	6	6	5514	5519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016510	TAA	2	6	6487	6492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016510	A	8	8	7946	7953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016510	AT	4	8	7966	7973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016510	A	8	8	8010	8017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016510	A	6	6	8054	8059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016510	TAA	2	6	9080	9085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016510	AAT	2	6	10159	10164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016510	ATT	2	6	10201	10206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016510	T	8	8	10208	10215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016510	A	7	7	10236	10242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016510	ATT	2	6	10256	10261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016510	CAA	2	6	10593	10598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016510	AAGAA	2	10	10615	10624	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016510	A	7	7	10654	10660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016510	AAAAAG	2	12	10681	10692	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016510	ACT	2	6	10703	10708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016510	T	6	6	10708	10713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016510	GTT	2	6	10747	10752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016510	ATCC	2	8	10834	10841	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016510	A	6	6	12466	12471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016510	T	7	7	12492	12498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016510	GAAT	2	8	12518	12525	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016510	TCT	2	6	12552	12557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016510	ATTA	2	8	12603	12610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016510	ATG	2	6	12999	13004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016510	AAT	2	6	13023	13028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016510	AAT	2	6	13054	13059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016510	GAG	2	6	17334	17339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016510	ATA	2	6	17351	17356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016510	TTAATT	2	12	17357	17368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016510	C	6	6	17377	17382	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_016510	AAC	2	6	19493	19498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016510	TAAA	2	8	19529	19536	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016510	ACC	2	6	19553	19558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_016510	A	6	6	19561	19566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016510	ATA	2	6	19639	19644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016510	AGAA	2	8	19649	19656	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016510	TAAA	2	8	25842	25849	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016510	A	6	6	25847	25852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016510	T	7	7	25881	25887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016510	T	6	6	26299	26304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016510	A	6	6	26326	26331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016510	ATT	2	6	26345	26350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016510	AT	3	6	26378	26383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016510	T	6	6	26427	26432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016510	GAT	2	6	26486	26491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016510	TTA	2	6	27844	27849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016510	TA	4	8	27863	27870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016510	CTTT	2	8	37970	37977	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_016510	CT	3	6	37984	37989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016510	AGA	2	6	38753	38758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016510	GAT	2	6	38795	38800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016510	T	7	7	38812	38818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016510	A	6	6	38824	38829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016510	GTT	2	6	38857	38862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016510	TGA	2	6	38892	38897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016510	AGA	2	6	38913	38918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016510	T	7	7	38932	38938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016510	AAAG	2	8	38969	38976	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016510	T	6	6	38983	38988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016510	TGA	2	6	39013	39018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016510	A	8	8	39056	39063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016510	AAT	2	6	39085	39090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016510	ATT	2	6	39176	39181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016510	ACTT	2	8	39196	39203	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_016510	TACT	2	8	39234	39241	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_016510	T	7	7	39264	39270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016510	TAC	2	6	39309	39314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016510	A	6	6	39320	39325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016510	TTAA	2	8	39356	39363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016510	ATA	3	9	39371	39379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016510	TA	3	6	39381	39386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016510	ATT	2	6	39427	39432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016510	T	8	8	39450	39457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016510	TGA	2	6	39501	39506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016510	TA	3	6	39516	39521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016510	ATT	2	6	39526	39531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016510	ATT	2	6	39535	39540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016510	AGG	2	6	39555	39560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016510	AT	3	6	39603	39608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016510	A	6	6	39612	39617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016510	ATT	2	6	39697	39702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016510	A	6	6	39725	39730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016510	TATG	2	8	39738	39745	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016510	T	8	8	39779	39786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016510	ATA	2	6	39789	39794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016510	AGT	2	6	39815	39820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016510	T	7	7	39829	39835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016510	TTA	2	6	39887	39892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016510	GCCC	2	8	39897	39904	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
109	NC_016510	TAC	2	6	39909	39914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016510	AAATG	2	10	39954	39963	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016510	A	6	6	45063	45068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016510	TA	3	6	45105	45110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016510	ATT	2	6	45122	45127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016510	T	6	6	45140	45145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016510	A	6	6	45168	45173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016510	A	6	6	45176	45181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016510	A	6	6	45185	45190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016510	T	9	9	45249	45257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016510	AAATA	2	10	49755	49764	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016510	A	6	6	49784	49789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016510	TAA	3	9	49806	49814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016510	A	6	6	49834	49839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016510	T	7	7	52311	52317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016510	ATA	2	6	52318	52323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016510	TAT	3	9	52338	52346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016510	A	6	6	52347	52352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016510	TAAT	2	8	52369	52376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016510	T	6	6	52482	52487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016510	TGA	2	6	52495	52500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016510	ATC	2	6	52518	52523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016510	GAT	2	6	52526	52531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016510	AAG	2	6	52534	52539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016510	AAGT	2	8	52542	52549	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016510	TGT	2	6	52748	52753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016510	AT	3	6	52762	52767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016510	ATA	2	6	52798	52803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016510	ATT	2	6	52870	52875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016510	TTAC	2	8	52896	52903	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_016510	A	6	6	52907	52912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016510	TGAT	2	8	52978	52985	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016510	AGA	2	6	53042	53047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016510	AGA	2	6	53057	53062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016510	AAC	2	6	53119	53124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_016510	A	7	7	53125	53131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016510	A	7	7	53150	53156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016510	A	6	6	53181	53186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016510	ATT	2	6	53243	53248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016510	AATT	2	8	53293	53300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016510	ATA	2	6	53301	53306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016510	A	7	7	54614	54620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016510	TGA	2	6	54629	54634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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342	NC_016510	TTA	2	6	96166	96171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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347	NC_016510	A	6	6	97399	97404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_016510	AGA	2	6	112221	112226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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436	NC_016510	ATTAT	2	10	112327	112336	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
437	NC_016510	T	7	7	112336	112342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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444	NC_016510	TAA	2	6	114564	114569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_016510	A	6	6	114578	114583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_016510	A	7	7	115414	115420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_016510	TTA	2	6	115425	115430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_016510	TAAG	2	8	115479	115486	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
450	NC_016510	TAA	2	6	115498	115503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_016510	TTCG	2	8	115570	115577	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
452	NC_016510	TCC	2	6	115579	115584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
453	NC_016510	TCT	3	9	115621	115629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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461	NC_016510	T	6	6	117930	117935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_016510	A	6	6	122615	122620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_016510	A	7	7	122727	122733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_016510	A	7	7	122795	122801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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